El Consejo General es una comunidad al servicio de la misión y la unidad de toda la Fraternidad. Está formado por seis hermanitas, una de las cuales es la responsable general. Son elegidas por el Capítulo (asamblea de hermanitas) y su mandato dura seis años. Luego, ellas releen su servicio y lo informan al Capítulo siguiente. Además de visitar las fraternidades dispersas por el mundo, viven y trabajan en Tre Fontane, donde colaboran estrechamente con los servicios generales (economato, secretariado y equipo de formación). Cada hermanita de Jesús es corresponsable, con el Consejo, de la misión y del carisma de la Fraternidad.
Los pasados 22 y 23 de septiembre de 2023 el Capítulo general ha elegido el nuevo Consejo General.